Thomas CUCCHI

Background

The domestication of plants and animals is a major evolutionary step in Human History. But because domestication is a continuum of interactions between animal and human societies it is very challenging to decipher from the archaeological record, especially the early step of human control for which bioarchaeologists lack reliable genetic or phenotypic markers. However, a breakthrough may be possible using markers which can detect the earliest anthropogenic environmental stress in the course of an animal’s lifetime; but only if these can be clearly associated with human control and disentangled from other environmental causal factors.

Objectives

To bridge this gap, The DENSS project will explore the environmental stress of captivity as a catalyst of the domestication process, by focusing on lifetime changes recorded in a wild animal enduring captivity and targeting the biomechanical stress of mobility reduction and its prints on the bone anatomy and the genome: (1) How do the locomotor changes induced by captivity affect the skeleton developmental trajectories compared to selective ones? (2) How far can these phenotypic reaction norms help us explore the anthropogenic impact in the archaeological record? (3) Will mobility reduction leave idiosyncratic prints on the genome and make epigenome trackable in the archaeological record? 

Approach

To address these questions DENSS will rely on an unique experiment of captivity effect over the musculo-skeleton growth of a wild ungulate model: the wild boar. DENSS will have access to the in vivo longitudinal record (CT, MRI, blood samples, muscular biopsies) as well as the cross-sectional record of the skeleton reaction norms in modern wild and domestic populations from France and Germany. Finally, DENSS will have access to the CT scans of skeleton remains from 4 Mesolithic and 9 Neolithic contexts in France and Germany, covering 4000 years of Neolithisation in Western Europe.

DENSS multidisciplinary project team (functional ecology, evolutionary biology and bioarchaeology) will bring together the latest developments in 3D image morphometrics and genomics to undertake four tasks: (1) Deciphering functional, ontogenetic and artificial selection signals in the 3D shape and microstrusture of two tarsal bones, (2) Identify the effect of captivity on skull development and integration, (3) Explore the anthropisation process of wild boar populations and the emergence of domestic phenotype during the Neolithisation of Western Europe, (4) Identify the transcriptomic and epigenetic signature of captivity.

Emergence, International and Public outreach

The DENSS project could provide a methodological breakthrough in one of the most interdisciplinary and vibrant areas of research in archaeology and anthropology. By capturing anthropogenic impacts happening at the ecological scale it will bridge the gap between archaeology and anthropology, contribute to international research on anthropogenic micro-evolutionary forces since the Late Glacial and explore the link between genotype and phenotype.

Beyond academia, domestication is a topic that engages a large portion of society. Furthermore, DENSS will provide direct evidence for the effect of a sedentary lifestyle on our body and on the epigenome, which is currently a hot topic in medical science and with the wider general public.

En bouleversant les contraintes écologiques, développementales et sociales de certaines espèces animales, la domestication a altéré la trajectoire évolutive de leur cerveau. Néanmoins, ces trajectoires évolutives sont encore très mal connues. À partir des années 1950, il a été montré que les animaux domestiques présentaient, en fonction des espèces, une réduction plus ou moins importante de leur volume cérébral par rapport à leur ancêtre sauvage, selon l’hypothèse d’une perte de leurs capacités cognitives. Plus récemment, l’imagerie cérébrale des races de chiens actuels a bien identifié des différences neuroanatomiques en fonction des sélections comportementales. En revanche, nous ne savons pas si et en quoi les changements et les adaptations neuroanatomiques au cours de l’histoire multimillénaire de la domestication diffèrent de ceux des deux derniers siècles, ni quelles ont été les périodes de ruptures et de continuité de ces changements au cours du long processus de domestication. 

DomesticBrain propose d’aborder pour la première fois ces questions à l’aide d’une approche pluridisciplinaire en traçant, dans le matériel paléontologique, archéologique et patrimonial, l’évolution neuroanatomique et crânienne des chiens et des cochons en Europe, depuis le Paléolithique supérieur pour les premiers et depuis le Mésolithique pour les seconds, et ce jusqu’à la période industrielle et l’émergence des races actuelles. Cette approche reposera sur un consortium de bioarchéologues, de paléoneuroanatomistes, de neuroscientifiques, de biologistes de l’évolution et d’historiens afin de (1) mieux comprendre les conséquences neuroanatomiques actuelles de la domestication chez ces deux taxons, (2) documenter leur évolution neuroanatomique en regard des dynamiques socio-culturelles et socio-économiques au cours des millénaires de la domestication et (3) comprendre le rôle de l’humanité dans l’évolution du cerveau de deux taxons domestiques emblématiques.