Les membres de l’UMR 7209 sont largement investis dans l’enseignement et la formation à la recherche en bioarchéologie à l’échelle régionale, nationale et internationale (cours, travaux pratiques d’archéozoologie et d’archéobotanique et encadrement des stages de laboratoire).
Cette finalité a pour objectif de former des professionnels de l’archéozoologie et de l’archéobotanique par une approche pluridisciplinaire. Les problématiques abordées se situent à l’interface des sociétés humaines, l’environnement et la biodiversité, de la Préhistoire ancienne jusqu’à la période moderne. Les cours et les travaux pratiques permettent aux étudiants d’acquérir les méthodes de terrain et de laboratoire. Sont ainsi enseignés les techniques de prélèvement et d’extraction des restes de faune et de flore lors des fouilles archéologiques, les notions fondamentales de morphologie, d'anatomie et de taxonomie nécessaires à leur analyse et identification et le traitement et l’analyse des données qualitatives et quantitatives. Les différentes approches méthodologiques permettent d’aborder des thématiques telles que la dynamique des biocénoses ; les pratiques de chasse, cueillette, pêche, agriculture et élevage ; la transformation et la consommation des produits d’origine animale et végétale ; la perception des animaux et des plantes et leur symbolisme culturel et rituel. Les enseignements sont adossés aux exceptionnelles collections naturalistes du Muséum ainsi qu’à ses plateaux techniques, en particulier ceux de l’UMR 7209 dédiés aux études bio-archéologiques.