La structure accueille des agents titulaires permanents dont 2 INRAP (J.-H. Yvinec, archéozoologue et archéoentomologiste ; O. Robin, archéozoologue), 2 CNRS (B. Clavel, archéozoologue et archéoichtyologue ; V. Zech-Matterne, carpologue), 2 CRAVO (G. Jouanin , archéozoologue ; M. Derreumaux, carpologue), des contractuels (E. Neveu, F. Toulemonde, carpologue), des stagiaires et étudiants MNHN mais aussi d’autres universités : Paris 1, Lille 3, Amiens, Nantes, Rennes.
Pour l’archéobotanique, entre 2013 et 2018, trois étudiants en master (Laurie Flottes 2014 M1 et 2015 M2 MNHN ; Sammy Ben Makhad 2017 M1 et 2018 M2 Rennes 2 ; Etienne Jeannesson 2018 M1 MNHN) ont été formés et trois thèses finalisées (M. Derreumaux, univ. Paris 1, doctorat soutenu en décembre 2012 ; F. Toulemonde, univ. Paris 1, juillet 2013 ; E. Neveu, univ. de Nantes, novembre 2017). V. Zech y a préparé son HDR (Rennes 1), soutenue en Mars 2015 à Paris, dans les locaux du MNHN.
Une thèse est en cours (Sammy Ben Makhad, MNHN, 2019-) suite à l'obtention d'une allocation doctorale via le dispositif DIM "Matériaux Anciens et Patrimoniaux", de la région Ile-de-France, projet
AGROFER- Gestion du potentiel agronomique des sols et rythmes d’occupation au second âge du Fer (500-30 av. n.è.) en France septentrionale : témoignages directs des restes carpologique. Co-portage V. Zech-Matterne/F. Malrain (UMR 8215 Trajectoires, de la sédentarisation à l'Etat, Paris 1/CNRS, Nanterre) ; Co-direction V. Zech-Matterne/M. Balasse (UMR 7209 AASPE, CNRS/MNHN, Paris).
Concernant l’archéozoologie, pour les mêmes dates, 6 étudiants en master (Maude Barme M1 et M2 en 2013 MNHN ; Nicolas Morand M2 2014 Rouen ; Mélanie Viola 2015 M2 MNHN ; Camille Clavel 2016 M2 ESA Angers ; Christelle Mailhan 2017 M2 MNHN, Philippe Pauthier 2017 M2 Paris 4) ont été formés. Deux thèses ont été soutenues, l’une en décembre 2016 (Anaïs Chalant, LabEx BCDiv, MNHN) et l’autre en novembre 2018 (Alice Bourgois, EA TRAME, UPJV)
Une thèse est en cours dans les locaux depuis octobre 2018 (Philippe Pauthier, allocataire de l’Univ. Paris IV). D’autre part le laboratoire a accueilli, pendant 16 mois, un post-doc en 2017/2018 (Colin Duval, EA TRAME, UPJV).
S'y ajoutent 18 stages (d’observation 3ème, d’initiation, de recherche).
Les collections de référence servent également d’assise aux expertises et recherches menées sur le terrain en France métropolitaine et à l’étranger, notamment en région Méditerranéenne, par l'équipe SPH (dir. S. Lepetz), devenue PaCEM (dir. V. Zech-Matterne). Chaque année des animations et portes-ouvertes sont organisées à l’occasion d'évènements nationaux : journées du Patrimoine, de l’Archéologie ou fête des Sciences. L'accueil de scolaires est régulier. Depuis 2013, 62 classes de primaire, collège et lycée, et plus de 1600 jeunes ont bénéficié de présentations en accord avec les programmes d'enseignement de leurs professeurs d'histoire ou SVT. Les publics scolaires incluent les élèves de l’Institut médico-éducatif de la Faisanderie (Compiègne). Enfin, des visites ou activités ont été organisées dans un cadre périscolaire ou extra-scolaire.