Une nouvelle lignée du genre Capra découverte dans les montagnes du Taurus en Turquie grâce à la génomique ancienne

L’unité d’archéozoologie et d’archéobotanique (AASPE) du MNHN a contribué à une étude paléogénétique sur l’origine de chèvre sauvages issues de fouille archéologiques d’Anatolie et de Caucase. Cette nouvelle étude sur le sujet qui vient d’être publié dans la revue Peer Community in Genomics montre que les chasseurs-cueilleurs de la fin l'Épipaléolithique il y a 14000 ans s’appuyait sur la chasse saisonnière de chèvres sauvages. Les données paléogénétiques issues de ces restes fossiles sont complétées par les génomes de chèvres de périodes médiévales dont les ossements ont été retrouvés par les archéozoologues de l’unité AASPE  au Nord de la Géorgie lors des fouilles archéologiques du Fort de Tamara dans les Gorges de Dariali. Pour la réalisation de ce travail il a aussi été fait appel aux collections ostéologiques modernes du Muséum national d’Histoire naturelle. Cette nouvelle lignée de Capra est un clade sœur des espèces de chèvres sauvage du Caucase, appelées aussi Tur (Capra cylindricornis et Capra caucasica), toutes deux désormais limitées à la région du Caucase. Ce " tur taurasien " oublié d’Anatolie, a probablement survécu aux changements climatiques du Pléistocène supérieur, en prenant refuge dans les montagnes du Taurus et son sort génomique demeure actuellement inconnu.

Mots clés : Génomique, ADN ancien, Capra, Géorgie, Caucase, Monts Taurus

Fort médiéval de Tamara surplombant dans les gorges de Dariali- Région du Mont Kazbeg, Géorgie.

Crédits

M. Mashkour

A novel lineage of the Capra genus discovered in the Taurus Mountains of Turkey using ancient genomics



Kevin G. Daly*, Benjamin S. Arbuckle, Conor Rossi, Valeria Mattiangeli, Phoebe A. Lawlor, Marjan Mashkour, Eberhard Sauer, Joséphine Lesur, Levent Atici, Cevdet Merih Erek, Daniel G. Bradley



Direkli Cave, located in the Taurus Mountains of southern Turkey, was occupied by Late Epipaleolithic hunters-gatherers for the seasonal hunting and processing of game including large numbers of wild goats. We report genomic data from new and published Capra specimens from Direkli Cave and, supplemented with historic genomes from multiple Capra species, find a novel lineage best represented by a ~14,000 year old 2.59X genome sequenced from specimen Direkli4. This newly discovered Capra lineage is a sister clade to the Caucasian tur species (Capra cylindricornis and Capra caucasica), both now limited to the Caucasus region. We identify genomic regions introgressed in domestic goats with high affinity to Direkli4, and find that West Eurasian domestic goats in the past, but not those today, appear enriched for Direkli4-specific alleles at a genome-wide level. This forgotten “Taurasian tur” likely survived Late Pleistocene climatic change in a Taurus Mountain refugia and its genomic fate is unknown.

Keywords: Genomics, ancient DNA, Capra, Taurus Mountains.

Marjan Mashkour (CNRS) et Joséphine Lesur (MNHN) – AASPE- UMR 7209

Daly KG, Arbuckle BS, Rossi C, Mattiangeli V, Lawlor PA, Mashkour M, Sauer E, Lesur J, Atici L, Cevdet CM and Bradley DG (2022) A novel lineage of the Capra genus discovered in the Taurus Mountains of Turkey using ancient genomics. bioRxiv, 2022.04.08.487619, ver. 5 peer-reviewed and recommended by Peer Community in Genomics. https://doi.org/10.1101/2022.04.08.487619