Origins and Genetic Legacy of Prehistoric Dogs

Le chien a été le premier animal domestiqué, probablement issu de loups, mais son origine reste incertaine. Anders Bergström et al. de l'Institut Francis Crick, et en collaboration avec  les Universitéz d'Oxford et de Vienne et des archéologues de plus de 10 pays ont séquencé 27 génomes de chiens anciens en provenance de multiples localités, allant de la Yakutie en Sibérie et la Suède jusqu’en Espagne, en passant par l’Iran, le Levant et l’Europe de l’Est. Ces génomes de chiens ont été ensuite analysés conjointement avec les génomes de 17 humains vivants aux mêmes endroits et aux mêmes époques. En analysant les génomes analysés, ainsi que d'autres génomes de chiens anciens et modernes, les auteurs ont découvert qu’il y a 11 000 ans, cinq lignées de chiens distinctes existait déjà; celles-ci ont donné naissance à des chiens au Proche-Orient, en Europe du Nord, en Sibérie, en Nouvelle-Guinée et aux Amériques. Ces lignages se sont mélangés et donnés naissance au chien d’aujourd’hui. Les premiers chiens européens étaient initialement génétiquement divers et semblent être originaires du Proche-Orient d’un côté et de la Sibérie de l’autre, mais cette diversité se perd à un moment donné et n’est plus présente chez les chiens européens actuels. En outre, la génétique de certaines populations de chiens est similaire à celle des humains, tandis que d'autres diffèrent, ce qui laisse supposer une histoire ancestrale complexe pour le meilleur ami des humains. Cette découverte révèle que la diversité observée aujourd'hui entre les chiens dans différentes parties du monde a son origine à l'époque où tous les humains étaient encore des chasseurs et des cueilleurs. L’Unité AASPE- CNRS/MNHN (Archéozoologie, Archéobotanique) a contribué à cette étude par l’apport d’ossements de chien en provenance d’Iran qui semble être une région importante dans la diffusion des chiens, sans doute par l’intermédiaire des populations agropastorales qui se déplaçaient avec leurs chiens.

L’archéozoologie et la paléogénétique nous réservent encore beaucoup de surprises sur nos origines et nos relations avec les animaux dans le passé.

Contact : Marjan.Mashkour@mnhn.fr

Voir l'information sur le site de l'Inee: https://inee.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/la-domestication-des-chiens-plusieurs-visages

Anders Bergström^1*, Laurent Frantz^2*, Ryan Schmidt^3,4, Erik Ersmark^5,6, Ophelie Lebrasseur^7,8, Linus Girdland-Flink^9,10, Audrey T. Lin^7,11,12, Jan Storå¹³, Karl-Göran Sjögren¹⁴, David Anthony¹⁵, Ekaterina Antipina¹⁶, Sarieh Amiri¹⁷, Guy Bar-Oz¹⁸, Vladimir I. Bazaliiskii¹⁹, Jelena Bulatović²⁰, Dorcas Brown¹⁵, Alberto Carmagnini², Tom Davy¹, Sergey Fedorov²¹, Ivana Fiore^22,23, Deidre Fulton²⁴, Mietje Germonpré²⁵, James Haile²⁶, Liora Kolska Horwitz²⁷, Evan K. Irving-Pease^7,28, Alexandra Jamieson⁷, Luc Janssens²⁹, Irina Kirillova³⁰, Julka Kuzmanovic-Cvetkovic³¹, Yaroslav Kuzmin^32,33, Robert J. Losey³⁴, Daria Ložnjak Dizdar³⁵, Marjan Mashkour^17,36, Mario Novak³⁷, Vedat Onar³⁸, David Orton³⁹, Maja Pasarić⁴⁰, Miljana Radivojević⁴¹, Dragana Rajković⁴², Benjamin Roberts⁴³, Hannah Ryan7, Mikhail Sablin⁴⁴, Fedor Shidlovskiy³⁰, Ivana Stojanović⁴⁵, Antonio Tagliacozzo²², Katerina Trantalidou⁴⁶, Inga Ullén⁴⁷, Aritza Villaluenga⁴⁸, Paula Wapnish⁴⁹, Keith Dobney^8,9,50, Anders Götherström¹³, Anna Linderholm⁵¹, Love Dalén^5,6, Ron Pinhasi^52*, Greger Larson^7*, Pontus Skoglund^1*

Affiliations:

1. The Francis Crick Institute, London, UK

2. Queen Mary University of London, London, UK

3. School of Archaeology and Earth Institute, University College Dublin, Dublin, Ireland

4. CIBIO - InBIO, University of Porto, Campus de Vairão, Portugal

5. Department of Bioinformatics and Genetics, Swedish Museum of Natural History, Stockholm, Sweden

6. Centre for Palaeogenetics, Svante Arrhenius väg 18C, Stockholm, Sweden

7. The Palaeogenomics and Bio-Archaeology Research Network, Research Laboratory for Archaeology and History of Art, University of Oxford, Oxford, UK

8. Department of Archaeology, Classics and Egyptology, University of Liverpool, Liverpool, UK

9. Department of Archaeology, University of Aberdeen, Aberdeen, UK

10. Liverpool John Moores University, Liverpool, UK

11. Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK

12. Department of Anthropology, National Museum of Natural History, Smithsonian Institution, Washington, DC, USA

13. Stockholm University, Stockholm, Sweden

14. Gothenburg University, Gothenburg, Sweden

15. Hartwick College, Oneonta, USA

16. Institute of Archaeology of the Russian Academy of Sciences, Moscow, Russian Federation

17. Bioarchaeology Laboratory, Central Laboratory, University of Tehran, Tehran, Iran

18. University of Haifa, Haifa, Israel

19. Irkutsk State University, Irkutsk, Russian Federation

20. University of Belgrade, Belgrade, Serbia

21. North-Eastern Federal University, Yakutsk, Russian Federation

22. Bioarchaeology Service, Museo delle Civiltà, Rome, Italy

23. Environmental and Evolutionary Biology Doctoral Program, Sapienza University of Rome, Rome, Italy

24. Baylor University, Waco, Texas, USA

25. Royal Belgian Institute of Natural Sciences, Brussels, Belgium

26. University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark

27. The Hebrew University, Jerusalem, Israel

28. Lundbeck GeoGenetics Centre, The Globe Institute, 1350 Copenhagen, Denmark

29. University of Leiden, Leiden, Netherlands

30. Ice Age Museum, Moscow, Russian Federation

31. Homeland Museum of Toplica, Prokuplje, Serbia

32. Sobolev Institute of Geology and Mineralogy of the Siberian Branch of Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russian Federation

33. Tomsk State University, Tomsk, Russian Federation

34. University of Alberta, Edmonton, Canada

35. Institute of Archaeology, Zagreb, Croatia

36. Archéozoologie, Archéobotanique, Sociétés, Pratiques et Environnements, AASPE, Centre National de la Recherche Scientifique, Muséum National d’Histoire Naturelle, Paris, France

37. Centre for Applied Bioanthropology, Institute for Anthropological Research, Zagreb, Croatia

38. Istanbul University-Cerrahpaşa, Istanbul, Turkey

39. University of York, York, UK

40. Institute of Ethnology and Folklore Research, Zagreb, Croatia

41. University College London, London, UK

42. Archaeological Museum Osijek, Osijek, Croatia

43. Durham University, Durham, UK

44. Zoological Institute of the Russian Academy of Sciences, Saint Petersburg, Russian Federation

45. Institute of Archaeology, Belgrade, Serbia

46. Hellenic Ministry of Culture & Sports, Athens, Greece

47. National Historical Museums, Stockholm, Sweden

48. Consolidated Research Group on Prehistory (IT-1223-19), University of the Basque Country (UPV-EHU), Vitoria-Gasteiz, Spain

49. The Pennsylvania State University, University Park, Pennsylvania, USA

50. Department of Archaeology, Simon Fraser University, Burnaby, BC., Canada

51. Texas A&M University, College Station, USA

52. Department of Evolutionary Anthropology, University of Vienna, Vienna, Austria

*Correspondence to: anders.bergstrom@crick.ac.uk (A.B.), l.frantz@qmul.ac.uk (L.F.), ron.pinhasi@univie.ac.at (R.P.), greger.larson@arch.ox.ac.uk (G.L.), pontus.skoglund@crick.ac.uk (P.S.)

Dogs were the first domestic animal, but little is known about their population history and to what extent it was linked to humans. We sequenced 27 ancient dog genomes and found that all dogs share a common ancestry distinct from present-day wolves, with limited gene flow from wolves since domestication but substantial dog-to-wolf gene flow. By 11,000 years ago, at least five major ancestry lineages had diversified, demonstrating a deep genetic history of dogs during the Paleolithic. Coanalysis with human genomes reveals aspects of dog population history that mirror humans, including Levant-related ancestry in Africa and early agricultural Europe. Other aspects differ, including the impacts of steppe pastoralist expansions in West and East Eurasia and a complete turnover of Neolithic European dog ancestry

Pour en savoir plus: https://www.sciencemag.org/news/2020/10/how-dogs-tracked-their-humans-across-ancient-world